Watanuki Kimihiro es un chico aparentemente normal, a excepción de que puede ver espectros. Un día al ser perseguido por uno de ellos, llega sin querer a una extraña tienda y lo recibe una mujer llamada Yuuko (aunque ella aclara que no es su verdadero nombre).La tienda, según dice ella, es para conceder el deseo más anhelado por una persona, pero claro, también tiene un precio, el cual debe ser del mismo valor que el deseo. Watanuki es algo incrédulo y solo busca la manera de salir. Yuuko le adivina su suerte mostrando así que es una especie de bruja. Watanuki le confiesa que lo que más desea, es dejar de ver a esos espectros. Yuuko, le dice que ese deseo puede hacérselo realidad, pero a cambio tendrá que trabajar para ella en la tienda hasta que el precio sea pagado. Es así como empieza la historia en la que vemos los deseos de diferentes personas en varios casos llenos de misterio, drama y un poco de humor.